Der Themenkomplex Informationssicherheit besitzt eine lange Tradition am Fraunhofer ISI. Bereits in den 1990er Jahren arbeitete die damalige Abteilung Informations- und Kommunikationssysteme zu Fragen der IT-Sicherheit.
Aktuell setzen sich die Forschungsarbeiten im Bereich Informationssicherheit vor allem mit der Sicherheit kritischer Infrastrukturen wie etwa vernetzten IT-Welten auseinander. Darüber hinaus werden die Auswirkungen neuer Technologien sowie von Überwachungs- und Sicherheitstechnologien auf Privatheit und Datenschutz untersucht und Datenschutz-Folgenabschätzungen vorgenommen.
Das Fraunhofer ISI bringt seine Expertise in der Fraunhofer-Allianz Big Data ein.